Las inundaciones fluviales son un problema creciente en zonas costeras debido a las profundas transformaciones ambientales que tienen lugar desde mediados del siglo XX. En cuencas costeras de la región mediterránea de Chile (32°-38° S) los esfuerzos para mitigar los procesos de inundación se han centrado en medidas estructurales. La presente investigación analiza la recurrencia histórica, factores morfométricos y estado hidrogeomorfológico mediante el índice IHG en cuencas costeras de la región del Biobío afectadas por inundaciones. Los sistemas fluviales presentaron 15 a 21 desastres en los últimos 30 años durante el invierno austral, asociado a sistemas frontales fríos debido al tiempo de concentración de las cuencas (9-17 h). El índice IHG fue deficiente y moderado en tramos de cauce intervenidos estructuralmente para mitigar las inundaciones fluviales, mientras que en zonas sin intervención la calidad fue muy buena o buena. Es necesario un cambio de paradigma en la gestión de las inundaciones en Chile, desde un enfoque estructural a un enfoque holístico basado en criterios de adaptación y administración de crecidas, en conjunto con un rol más activo de la planificación del territorio y actuaciones urbanas con una visión más integrada, sostenible, multidisciplinaria y articulada entre diferentes actores.